绝大多数人体内携带的HPV病毒能够彻底清除，只有极少部分的人可能会处于长期携带状态。一般1-2年的时间机体能够将HPV病毒清除，但由于每个人的体质不同以及感染的HPV类型不同，所以清除HPV的具体时间，以及一个疗程是多长时间会有一定的差异，并不能准确说明。
有些感染HPV人群比较年轻，在感染HPV病毒以后，并不会导致尖锐湿疣或是宫颈病变，而是单纯出现HPV病毒的感染，并且自身的抵抗力又比较好，所以很快能够将HPV病毒完全清除。这类人群可能不需要用任何的药物就能够将体内的HPV病毒清除，并且也不会对身体造成其他特殊的不良影响。
但有些人群可能因为体质比较差，年龄又比较大，在感染HPV病毒以后，没办法将HPV病毒自然清除，而是会处于长期携带的状态，可能会出现尖锐湿疣、宫颈病变等情况，可以遵医嘱使用重组人干扰素α2a栓或者是人干扰素α2b凝胶来进行辅助治疗，1个月为一疗程，坚持治疗3个月，之后到医院复查治疗效果，如果没有转阴，则需要继续治疗，治疗后6个月无复发者，复发概率较小。